Вторая часть Prototype расскажет вам о превращении обычного человека в абсолютное оружие. Вы можете сеять хаос на улицах города, используя уникальные возможности, полученные в результате заражения инфекцией. Трансформируйте свое тело и поглощайте врагов. Используйте уникальные возможности перемещения, чтобы исследовать руины Нью-Йорка в поисках новых приключений. Меняйтесь, убивайте и сражайтесь!